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How big is Hélice alfa?

1.2 nanómetros!

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Hélice alfa

Una hélice alfa es un tramo de una cadena de proteína enrollado en una espiral que gira hacia la derecha, como una escalera de caracol. Es la más común de las formas regulares en que se pliegan las cadenas de proteínas. Si se cuentan las cadenas laterales que sobresalen de la espiral, tiene unos 1,2 nanómetros de ancho. Un nanómetro es una milmillonésima de metro.

Tamaño

Una proteína es una cadena larga de moléculas más pequeñas llamadas aminoácidos. En una hélice alfa, el esqueleto de la cadena se enrolla alrededor de una línea central y la cadena lateral de cada aminoácido apunta hacia fuera, como las cerdas de una escobilla para botellas. Según la investigación publicada, el ancho de toda la varilla, con las cadenas laterales incluidas, es de aproximadamente 1–1,2 nanómetros. Los 1,2 nanómetros que se muestran arriba están en el extremo superior de ese intervalo.

En toda su longitud, la hélice es muy regular. Cada vuelta contiene 3,6 aminoácidos y sube 0,54 nanómetros, de modo que cada aminoácido añade 0,15 nanómetros a la longitud. La espiral se mantiene en su forma gracias a los enlaces de hidrógeno, atracciones débiles que unen cada aminoácido con el que está cuatro posiciones más allá en la cadena. Una hélice puede ser corta o larga: una formada por 20 aminoácidos mide unos 3 nanómetros de largo.

Comparaciones de tamaño

  • La doble hélice del ADN, de 2 nanómetros de ancho, tiene aproximadamente 1,7 veces el ancho de una hélice alfa.
  • Una hélice de 20–25 aminoácidos, de 3–3,75 nanómetros de largo, es lo bastante larga para atravesar la zona central, que repele el agua, de la bicapa fosfolipídica de una membrana celular. Las proteínas que atraviesan las membranas suelen hacerlo con hélices alfa.
  • Una proteína típica tiene entre 3 y 6 nanómetros de diámetro, es decir, de unas 2,5 a 5 veces el ancho de una hélice alfa.
  • Entre unas 67 000 y 83 000 hélices alfa, colocadas unas al lado de otras, abarcarían el grosor de un cabello humano, que mide entre 80 000 y 100 000 nanómetros de grosor.
  • Agrandada mil millones de veces, una hélice alfa tendría 1,2 metros de ancho, y cada vuelta subiría 54 centímetros. Un cabello humano tendría de 80 a 100 kilómetros de ancho.

Cómo se descubrió

Linus Pauling, Robert Corey y Herman Branson propusieron la hélice alfa en 1951. Pauling había dado con la forma tres años antes, mientras guardaba cama con un resfriado en Oxford, en Inglaterra. Dibujó una cadena de proteína en una hoja de papel y la plegó hasta que una vuelta de la espiral pudo formar enlaces de hidrógeno con la siguiente. El dibujo del artículo de 1951 mostraba una hélice que giraba hacia la izquierda, la imagen especular de las que se encuentran en las proteínas naturales.

En la primavera de 1951, Max Perutz leyó el artículo y se dio cuenta de que el paso de 0,15 nanómetros por cada aminoácido debería aparecer cuando los rayos X se dispersan en una proteína. Puso a prueba la idea con un pelo de caballo y encontró la señal exactamente donde la hélice la predecía. En 1957 y 1959, el equipo de John Kendrew elaboró el mapa de la mioglobina, una proteína que se une al oxígeno, y vio sus hélices como varillas rectas. Aproximadamente el 75 % de su cadena está enrollada en hélices, de 7–24 aminoácidos de longitud, y todas giran hacia la derecha.

Fuentes

  • α-helix. In Foundations of Protein Structure. EMBL-EBI Training.
  • Protein Structure. In Organic Chemistry. OpenStax, 2023.
  • Predicting Helical Topologies in RNA Junctions as Tree Graphs. Laing et al., PLoS ONE, 2013.
  • Type Three Secretion System in Attaching and Effacing Pathogens. Gaytán et al., Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2016.
  • The Discovery of the α-Helix and β-Sheet, the Principal Structural Features of Proteins. Eisenberg, Proceedings of the National Academy of Sciences, 2003.
  • Myoglobin and the Structure of Proteins. John C. Kendrew, Nobel Lecture, 1962.
  • Components and Structure. In Biology 2e, 2nd edition. OpenStax, 2018.
  • How Big Is the "Average" Protein?. In Cell Biology by the Numbers. Milo and Phillips, Garland Science, 2015.
  • DNA Structure and Sequencing. In Biology 2e, 2nd edition. OpenStax, 2018.
  • Just How Small Is "Nano"?. National Nanotechnology Initiative.

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